5-甲基胞嘧啶(m5C)修飾是RNA最普遍的修飾之一。m5C修飾通過影響RNA出核、穩定和剪接等過程來參與多種生物學功能。造血干祖細胞為支持生命持續,分化為各種類型的血細胞,是維持血液系統正常功能的核心細胞。造血干祖細胞在發育過程中經歷快速的全局轉錄重編程,這些變化有助于細胞狀態和功能轉變。但是,全局轉錄重編程的分子機制以及NA m5C修飾在造血干祖細胞發育過程中是否發揮調控功能等問題尚不明晰。
中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)楊運桂研究團隊、動物研究所劉峰團隊,聯合中國醫學科學院血液病醫院王璐團隊,報道了Ybx1蛋白介導的mRNA m5C修飾在發育性造血中的關鍵作用,并為優化造血干祖細胞體外擴增策略提出了新見解與表觀轉錄組學策略。
該研究利用斑馬魚模型,運用轉錄組測序和RNA甲基化測序等技術,繪制出主動脈-性腺-中腎區新生造血干祖細胞、尾部造血組織區造血干祖細胞以及成體腎髓區造血干祖細胞不同發育階段的RNA m5C修飾動態圖譜。研究顯示,斑馬魚尾部造血組織中,m5C修飾水平最高。同時,主動脈-性腺-中腎區新生造血干祖細胞發育至尾部造血組織區造血干祖細胞過程中,m5C修飾水平升高的mRNA表達更穩定。實驗分析發現,RNA m5C修飾的識別蛋白Ybx1在尾部造血組織區的造血干祖細胞中高表達,并通過結合m5C修飾的細胞周期相關mRNA調控造血干祖細胞增殖。而Ybx1缺失抑制造血干祖細胞的增殖,可通過過表達Ybx1蛋白恢復其擴增能力。
進一步,該研究在小鼠胎肝Lineage-Sca-1+c-Kit+造血干祖細胞模型中觀測到同樣的生物學現象,表明m5C修飾通過Ybx1蛋白介導細胞周期相關mRNA的穩定性,從而在不同物種中調控造血干祖細胞的擴增功能。
上述研究揭示了m5C修飾在調控造血干祖細胞擴增中的作用,為造血干祖細胞研究提供了新視角。
相關研究成果以RNA m5C methylation mediated by Ybx1 ensures hematopoietic stem and progenitor cell expansion為題,發表在《細胞報告》(Cell Reports)上。研究工作得到國家自然科學基金委員會、科學技術部、中國科學院等的支持。
論文鏈接
Ybx1介導RNA m5C修飾確保HSPC擴增模式圖
本文鏈接:研究揭示RNA m5C修飾調控造血干祖細胞擴增機制http://m.lensthegame.com/show-12-818-0.html
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