1月29日，記者從華南農業大學獲悉，該校豬禽種業全國重點實驗室教授張哲、李加琪團隊與國內外多個團隊合作，在豬基因組學領域取得重要進展。科研人員研究整理出迄今最大規模的豬轉錄組大數據集，構建了多組織遺傳調控效應圖譜，為完善豬基因組功能注釋提供了極為豐富的數據資源。相關研究成果近日在線發表于《自然·遺傳學》。
我國是豬肉生產和消費第一大國。“鑒定豬的重要經濟性狀的育種靶點，解析其遺傳調控機制，研發配套技術，并把技術創新運用到實際育種，培育突破性中國特色新品種，是打好種業翻身仗的關鍵。”張哲介紹，他們從公共數據庫中收集了全球100多個豬品種的所有轉錄組數據和其他多組學數據，涵蓋了138種組織或細胞類型，獲得了5種轉錄本的2292954個分子表型。
在此基礎上，研究團隊深入解析了豬多組織基因表達模式，鑒定出34個代表性組織的特異表達基因。同時，該研究通過開展大規模分子數量性狀基因座（QTL）定位，發布了迄今最大規模的豬多組織遺傳調控效應圖譜，并通過整合多組學信息，深入探討了遺傳調控變異的特性和分子機制。
據介紹，研究團隊通過整合遺傳調控效應圖譜，全面系統地解析了豬復雜性狀遺傳調控機制。研究人員利用多種統計分析方法，將圖譜與268個豬復雜性狀全基因組關聯研究（GWAS）的統計量結果進行整合挖掘，揭示了多組織分子QTL對豬復雜性狀遺傳機制解析具有重要作用。此外，研究團隊還解析了其中80%的GWAS信號與多組織分子表型的潛在遺傳關聯，為豬復雜性狀遺傳機制的精準解析提供了分析流程范例。
為深入發掘豬作為生物醫學模型的潛力，研究團隊通過遺傳調控水平的物種間比較分析，揭示了豬和人類基因組中共享的遺傳調控效應。研究團隊發現了89個顯著相關的人類—豬性狀組合，表明了豬和人類在復雜性狀中具有相似的遺傳調控效應。
1月29日，記者從華南農業大學獲悉，該校豬禽種業全國重點實驗室教授張哲、李加琪團隊與國內外多個團隊合作，在豬基因組學領域取得重要進展。科研人員研究整理出迄今最大規模的豬轉錄組大數據集，構建了多組織遺傳調控效應圖譜，為完善豬基因組功能注釋提供了極為豐富的數據資源。相關研究成果近日在線發表于《自然·遺傳學》。
我國是豬肉生產和消費第一大國。“鑒定豬的重要經濟性狀的育種靶點，解析其遺傳調控機制，研發配套技術，并把技術創新運用到實際育種，培育突破性中國特色新品種，是打好種業翻身仗的關鍵。”張哲介紹，他們從公共數據庫中收集了全球100多個豬品種的所有轉錄組數據和其他多組學數據，涵蓋了138種組織或細胞類型，獲得了5種轉錄本的2292954個分子表型。
在此基礎上，研究團隊深入解析了豬多組織基因表達模式，鑒定出34個代表性組織的特異表達基因。同時，該研究通過開展大規模分子數量性狀基因座（QTL）定位，發布了迄今最大規模的豬多組織遺傳調控效應圖譜，并通過整合多組學信息，深入探討了遺傳調控變異的特性和分子機制。
據介紹，研究團隊通過整合遺傳調控效應圖譜，全面系統地解析了豬復雜性狀遺傳調控機制。研究人員利用多種統計分析方法，將圖譜與268個豬復雜性狀全基因組關聯研究（GWAS）的統計量結果進行整合挖掘，揭示了多組織分子QTL對豬復雜性狀遺傳機制解析具有重要作用。此外，研究團隊還解析了其中80%的GWAS信號與多組織分子表型的潛在遺傳關聯，為豬復雜性狀遺傳機制的精準解析提供了分析流程范例。
為深入發掘豬作為生物醫學模型的潛力，研究團隊通過遺傳調控水平的物種間比較分析，揭示了豬和人類基因組中共享的遺傳調控效應。研究團隊發現了89個顯著相關的人類—豬性狀組合，表明了豬和人類在復雜性狀中具有相似的遺傳調控效應。
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